Муниципальное образование располагается в пределах северной части Прикаспийской низменности на левобережье р.Волга, примерно в 55 км от ее русла. Граница муниципального образования «Поселок Нижний Баскунчак» начинается от точки пересечения границ Российской Федерации и Республики Казахстан. Далее граница проходит по линии государственной границы между Российской Федерацией и Республикой Казахстан. Затем граница идет в юго-западном направлении на протяжении 4300 м, далее идет в юго-восточном направлении на протяжении 9300 м , затем идет в юго-западном направлении на протяжении 6800м. Далее граница идет в юго-западном направлении на протяжении 11200м, затем идет в северо-западном направлении на протяжении 6200 м, далее идет в юго-западном направлении на пртяжении 8000м. Затем граница идет в северо-западном направлении на пртяжении 8000м, далее в западном направлении на протяжении 1600м, затем в северном направлении на протяжении 6500 м, далее в западном направлении на 3000м. Далее граница идет в северном направлении на протяжении 11500 м до первоначальной точки.

 Площадь муниципального образования — 2456 га.

   На территории муниципального образования имеется ряд месторождений и проявлений полезных ископаемых. Это глины и суглинки для производства кирпича, песок для приготовления бетона, силикатных изделий и стекла, глины с сероносными линзами, гипс строительный, лечебные грязи, соль, супеси и суглинки для производства гончарного производства и ряд других глин, суглинков и супесей для приготовления растворов различных марок, имеются запасы минеральных вод. На территории находится соляное озеро площадью 110 кв.километров. Местность, окружающая Баскунчакское озеро, резко выделяется из общей картины ровной и однообразной степи. Уже издали над гладким горизонтом степи виднеется макушка горы Большое Богдо. Самая высокая точка Прикаспия — соляной купол горы Большое Богдо — 149 м. Окрестности озера изрыты и изборождены оврагами и провалалами. Глина и песок сменяются известняком, гипс и алебастр образуют стены оврагов, то обсыпавшихся, то имеющих форму пещер и полуразрушенных зданий, как бы созданных рукою человека.

Климат района резко континентальный, засушливый с резкими сезонными и суточными колебаниями температуры и влажности воздуха. Среднегодовое количество осадков составляет около 280-290 мм в год. Зимой осадки выпадают в виде мокрого снега и дождя. летом ливневые дожди сопровождаются грозами, иногда градом. Лето жаркое и сухое. Абсолютный максимум температур равен +42 градусов С. Зима умеренно холодная. Абсолютный минимум составляет -37 градусов С. Территория относится к стоительно-климатическому району IV г. Глубина промерзания почвы средняя — 62 см, максимальная — 85 см. Район подвержен воздействию сильных ветров с пыльными бурями.

На территории муниципального образования «Поселок Нижний Баскунчак» имеются:

1. Государственный природный заповедник «Богдинско-Баскунчакский», учрежденный Постановлением Правительства РФ от 18.11.1997 года №1445. который является природоохранным, научно-исследовательским и эколого-прсветительным учреждением федерального значения.

2.  Государственный природный заказник Астраханской области «Богдинско-Баскунчакский». Заказник расположен в Ахтубинском районе и имеет региональное значение. Государственный природный заказник создан Постановлением Главы Администрации Астраханской области от 25.11.93 N 196 «Об организации государственного природного заказника «Богдинско-Баскунчакский».